La résistance aux antimicrobiens dans les chaînes de valeur mondiales des cultures vivrières

Une équipe de chercheurs de l’École d’hygiène et de médecine tropicale de Londres, de l’Institut international de recherche sur le bétail, de l’Université de Copenhague, du Royal Veterinary College et de CABI a réalisé une analyse documentaire systématique afin de consolider l’état actuel des connaissances sur la résistance aux antimicrobiens dans les chaînes de valeur des cultures vivrières à l’échelle mondiale. Cette étude est publiée dans la revue Frontiers in Sustainable Food Systems.

L’étude résume et compare les données descriptives de base sur la résistance aux antimicrobiens détectée dans les cultures et les intrants agricoles à l’échelle mondiale. Cela a permis d’identifier les lacunes dans la compréhension des risques potentiels pour la sécurité alimentaire des consommateurs.

Une recherche dans quatre bases de données bibliographiques utilisant les synonymes de résistance aux antimicrobiens dans les chaînes de valeur des cultures alimentaires a permis d’identifier 196 études d’intérêt provenant de 49 pays, principalement en Asie (89 études) et en Afrique (38 études).

Les quatre espèces d’intérêt les plus fréquemment enregistrées étaient Escherichia coli, Salmonella enterica, et Enterococcus faecium ou Enterococcus faecalis. Les cultures les plus échantillonnées étaient les salades, les légumes et les herbes culinaires.

L’examen a révélé que la résistance antimicrobienne acquise chez les agents pathogènes humains est disséminée dans les chaînes de valeur des cultures alimentaires dans plusieurs régions du monde.

Cependant, les modèles de distribution de la résistance aux antimicrobiens étaient variables. La résistance au chloramphénicol a été signalée dans des échantillons de la chaîne de valeur alimentaire dans des pays à revenu faible ou intermédiaire en Asie et en Afrique, tandis que la résistance à la vancomycine chez les entérocoques a été signalée dans des cultures alimentaires de pays à revenu élevé.

“Cette revue confirme le signalement généralisé de la résistance aux antimicrobiens d’importance médicale dans les microbes pathogènes pour l’homme isolés des cultures, tant sur le terrain que sur le marché“, indiquent les auteurs.

Cependant, il est difficile de quantifier de manière concluante les risques d’exposition des consommateurs en raison du faible nombre d’études longitudinales et des diverses méthodes d’échantillonnage utilisées.

“Il est impossible de tirer des conclusions fermes sur la prévalence et l’importance relative des différents types de résistance et des voies de transmission de la résistance aux antimicrobiens en raison de l’hétérogénéité substantielle entre les méthodes et les conditions d’étude“, mettent en garde les auteurs.

“Il est nécessaire d’inclure la résistance antimicrobienne d’origine agricole dans la surveillance des risques de sécurité alimentaire des aliments d’origine végétale, et les défis auxquels sa surveillance est confrontée“, recommandent les auteurs.

Au vu de c qui précède, en attendant que de plus amples recherches soient menées sur le sujet, les politiques, les agriculteurs et les consommateurs doivent veiller à l’application du Plan d’Action mondial pour combattre la résistance aux antimicrobiens. Ce dernier recommande de :

• Mieux faire connaître et comprendre le problème de la résistance aux antimicrobiens grâce à une communication, une éducation et une formation efficaces ;
• Renforcer les connaissances et les bases factuelles par la surveillance et la recherche ;
• Réduire l’incidence
  des infections par des mesures efficaces d’assainissement, d’hygiène et de prévention des infections ;
• Optimiser l’usage des médicaments antimicrobiens en santé humaine et animale;
• Dégager les arguments économiques en faveur d’investissements durables qui tiennent compte des besoins
  de tous les pays et accroître les investissements dans la mise au point de nouveaux médicaments,
  outils diagnostiques, vaccins et autres interventions.

Sources: 

• Brunn, A., Kadri-Alabi, Z., Moodley, A., Guardabassi, L., Taylor, P., Mateus, A. et Waage, J. 2022. Caractéristiques et occurrence mondiale des agents pathogènes humains hébergeant une résistance aux antimicrobiens dans les cultures vivrières : A scoping review. Frontiers in Sustainable Food Systems 6 : 824714.
• International Livestock Research Institute